Rò miệng nối xảy ra ở bệnh nhân phẫu thuật đường tiêu hóa trên (foregut surgery) chủ yếu được xử trí bằng các phương pháp nội soi, trong đó chủ yếu gồm liệu pháp hút áp lực âm, đặt stent và dẫn lưu.
Những bệnh nhân cần can thiệp phẫu thuật có tình trạng dinh dưỡng kém hơn và nhiều yếu tố nguy cơ trước mổ hơn so với nhóm được điều trị bằng nội soi.
Thành phần hệ vi sinh vật (microbiome) tại vị trí rò thay đổi theo phương thức điều trị; đáp ứng thành công với nội soi liên quan đến ưu thế của Bacteroides và Firmicutes, trong khi sự tăng sinh của Proteobacteria tương quan với thất bại phẫu thuật.
Hiểu rõ hồ sơ vi khuẩn trong các trường hợp rò đường tiêu hóa cho thấy dinh dưỡng và môi trường vi sinh có ảnh hưởng đáng kể đến quá trình lành vết thương và có thể định hướng các chiến lược điều trị trong tương lai.