多耐性結核菌の混合感染と異質耐性:上海におけるゲノム研究の知見

多耐性結核菌の混合感染と異質耐性:上海におけるゲノム研究の知見

ハイライト

  • 上海の多耐性結核症(MDR-TB)患者の10.8%で混合感染が確認され、個々の宿主内での株の多様性が著しかった。
  • 薬剤感受性と耐性の細菌集団が共存する異質耐性は、患者の16.5%で観察され、二次抗結核薬にかかわる頻度が高いことが示されました。
  • 年齢が高いこと、糖尿病があること、混合感染があることは、異質耐性の重要なリスク要因でした。
  • 混合感染と異質耐性は、現象型と遺伝子型の薬剤感受性試験の間の不一致に大きく寄与し、MDR-TBの診断と治療に課題をもたらしました。

研究の背景

多耐性結核症は、特に中国などの高負担国において、引き続き主要な世界的な公衆衛生上の課題です。単一の患者体内に複数の結核菌(M. tuberculosis)株が存在する「混合感染」や、遺伝的に耐性と感受性の細菌集団が共存する「異質耐性」の存在は、有効な診断と管理をさらに複雑化させます。これらの現象は、従来の薬剤感受性試験(DST)結果を曖昧にし、適切な治療選択を妨げ、耐性株の継続的な伝播を促進する可能性があります。混合感染と異質耐性の疫学と臨床的影響を理解することは、MDR-TB対策戦略の最適化にとって重要です。

研究デザイン

この人口ベースのゲノム疫学研究では、2005年1月1日から2018年12月31日までに上海で診断されたMDR-TB症例を分析しました。研究対象群には、MDR-TBが確認された936人の患者が含まれました。包括的な人口統計学的、臨床的、実験室データが収集され、現象型と遺伝子型のDST結果が含まれました。結核菌株の全ゲノム配列解析(WGS)が行われ、患者1人あたりの複数の株(混合感染)の存在と、少数の耐性付与変異を特定して異質耐性を特徴づけることが行われました。多変量ロジスティック回帰モデルが用いられ、混合感染と異質耐性に関連する独立因子が同定されました。これらの状況がDSTの不一致に与える影響と、治療結果への影響も評価されました。

主要な知見

MDR-TB対象群の10.8%(101/936)が混合感染を示し、遺伝的に異なるM. tuberculosis株の同時感染が確認されました。異質耐性は16.5%(154/936)の症例で見つかり、一次薬剤よりも二次抗結核薬に対する耐性の発生率が高いことが示されました(P < 0.01)。

60歳以上の高齢の患者は、異質耐性の調整オッズ比(aOR)が1.91(95%CI: 1.02–3.57)と高くなりました。同様に、糖尿病は重要なリスク要因(aOR 2.59、95%CI: 1.36–4.91)となりました。特に、混合感染は異質耐性と強く関連しており(aOR 2.85、95%CI: 1.67–4.88)、宿主内の複雑な微生物動態を強調しています。

現象型と遺伝子型のDSTの間に不一致がある257株のうち、約22.6%(58/257)が混合感染と異質耐性によるものと考えられます。特に、エタンブトール(EMB)に対する異質耐性を持つ株は、現象型と遺伝子型の結果の不一致率が、異質耐性がない株と比較して有意に高かった(29.1% 対 17.2%、P < 0.05)。

重要なのは、現象型的には感受性だが遺伝子型的には耐性である株は、少数または低頻度の耐性変異を持ち、混合感染と異質耐性のある患者でより多く見られる点です。これらの低頻度の耐性集団は、標準的な培地ベースのDSTでは検出されず、薬剤耐性が過小評価され、治療失敗の可能性があることを示しています。

専門家のコメント

この研究は、混合感染と異質耐性が、MDR-TBの診断と管理の複雑さに大きく寄与していることを強力なゲノム的証拠で示しています。少数の耐性変異体の同定は、異質な細菌集団を捉えることができるより敏感な分子診断ツールの必要性を示唆しています。また、糖尿病と異質耐性との関連は、結核症患者の併存疾患の統合管理の必要性を強調しています。

ただし、本研究は観察研究であり、単一の大都市地域に限定されているため、他の地域への一般化には注意が必要です。混合感染と異質耐性を臨床的な治療結果と結びつけたさらなる前向き研究は、その予後的重要性の理解を深めるでしょう。現在のWHOガイドラインでは、異質耐性の影響について具体的に言及されておらず、今後の更新で考慮されるべきです。

結論

上海のMDR-TB患者では、混合感染と異質耐性が一般的であり、正確な薬剤耐性検出と効果的な治療に課題をもたらしています。これらの存在は、特にエタンブトールなどの二次薬剤において、現象型と遺伝子型のDST結果の間の不一致の大部分を占めています。医師や微生物学研究所は、DSTの解釈と治療方針の設計時にこれらの現象に注意する必要があります。深層シーケンシングや個別化療法を含む高度な診断アプローチが、MDR-TBの進化する複雑さに対処し、患者の結果を改善するために不可欠です。

資金源とClinicalTrials.gov

元の研究は、参照文献に詳述されている国レベルおよび機関レベルの助成金によって支援されました。この疫学研究に関連する登録された臨床試験番号は言及されていません。

参考文献

Liu Y, Zhang Y, Lu X, Wu Z, Li M, Zhang R, Lu Y, Hou R, Ji Y, Zhang Q, Jiang Q, Li J, Jiang Y, Wang Y, Yuan J, Takiff HE, Chen X, Shen X, Yang C. Mixed infections and heteroresistance of Mycobacterium tuberculosis among multidrug-resistant tuberculosis in China: a genomic epidemiology study. Emerg Microbes Infect. 2025 Dec;14(1):2534656. doi:10.1080/22221751.2025.2534656. Epub 2025 Aug 1. PMID: 40748858; PMCID: PMC12320256.

World Health Organization. WHO consolidated guidelines on drug-resistant tuberculosis treatment. 2020 update. Geneva: WHO; 2020.

Meehan CJ, Goig GA, Kohl TA, et al. Whole genome sequencing of Mycobacterium tuberculosis: current standards and open issues. Nat Rev Microbiol. 2019;17(9):533-545. doi:10.1038/s41579-019-0214-5.

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